På en konferens på Island träffar Hanna och Margareta den mystiske Pjotr. Detta möte visar sig ha konsekvenser i framtiden.
25 år senare är Hanna svensk underrättelseofficer, Margareta talman i Sveriges Riksdag och Pjotr befäl på en undervattensfarkost som tagit sig in i Stockholms farvatten. Johan, Hannas chef, har kontakt med Pjotr och låter denne färdas in i Stockholm. Men Johan inleder samtidigt arbetet för att skydda ämbetet mot en attack. Jakten på en "mullvad" intensifieras.
Återigen träffas de tre, men nu under andra omständigheter. Kan de lita på varandra eller har de alla något att dölja? "I mörkrets famn" är en unik spänningsroman som utspelar sig under tre intensiva höstdagar.