Pythonによるバイオデータ解析入門

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By 山内長承

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※この電子書籍は紙版書籍のページデザインで制作した固定レイアウトです。
バイオのデータもPythonで!
生物学に関わる理解・研究では、コンピュータによるデータ処理が欠かせないものとなってきています。生物学の扱う系はもともと非常に複雑で雑音が多く、統計的な解析が広く使われてきましたが、特に最近のDNA/RNA解析ではいわゆる次世代シーケンサ(NGS)が大量のDNA配列データを生み出してそれを整理しなければならないなど、コンピュータによるデータ処理が必須になっています。
 本書は、生物学分野において行われる、さまざまなデータ解析処理について、Pythonを用いて行う方法を解説し、理解することを目的としています。従来、簡単な処理はExcelを使ったり、RやSPSSなどの統計処理を主目的とする言語・ソフトウェアパッケージが用いられてきました。そのなかで本書は、比較的新しく、機械学習やデータ分析に優れたプログラミング言語であるPython を使って、初歩的なデータ処理をどのように行えばよいのかを紹介しています。
第 1 章 バイオデータ処理
第 2 章 プログラムを動作させるための知識
第 3 章 Pythonによる入力・出力データ加工のためのプログラミング
第 4 章 Pythonからバイオデータを扱うライブラリ
第 5 章 可視化のためのライブラリ
第 6 章 統計処理に便利な汎用の統計パッケージ
第 7 章 変異解析・発言解析の流れの例
Pythonによるバイオデータ解析入門