古老的庄园里埋藏着无数的秘密：上百个紧锁的房间，神秘的夜半哭声，会带路的知更鸟，乖戾的老园丁，可以与动物们交流的男孩，还有一座被封闭的秘密花园！书中主人公玛丽因为印度的一场霍乱，成了孤儿，而被送往这个古老且神秘的远在英国约克郡的米瑟斯韦特庄园，和姑父克雷文先生一起生活。玛丽虽然从小与父母一起生活在印度，但并未享受过来自父母的亲情，而土著仆人对她的百依百顺，使她变得任性又乖戾。不过，玛丽在秘密花园里秘密成长，她内心也开始秘密地复苏，并探索出了一个又一个秘密。最后，她和她的伙伴们终于战胜"心魔"，摒弃了所有令人讨厌的坏毛病，变得善良、温和、富有爱心。他们把这一切，都归功于秘密花园，归功于大自然的魔力。