Versailles, à la cour du roi Louis XV, dans les années 1750. Charles-Geneviève Beaumont, dit le Chevalier d'Éon, est un espion français, célèbre pour son habillement : il se faisait passer pour une femme. Impressionné par son talent exceptionnel d'imitation et passionné d'espionnage et de diplomatie secrète, Louis XV l'engage au service du « Secret du Roi ». Éon prête serment et commence son entraînement pour une mission secrète de plusieurs mois à l'étranger pour servir son Royaume.