《Why? 미생물》에는 미생물이란 무엇인지, 종류에는 어떤 것들이 있는지, 사람에게 도움을 주는 미생물과 해를 끼치는 미생물에는 어떤 것이 있는지 등 미생물에 대한 모든 것이 담겨 있다. 특히 눈으로 볼 수 없어 이해하기 힘든 미생물의 세계를 재미있는 만화와 생생한 사진, 정밀한 일러스트로 소개, 눈으로 보듯 생생하게 담아 내 어린이들의 이해를 돕도록 했다.