Esta epístola é a história de três personagens principais: Onésimo, Filemom e Paulo e sua interação.

Na carta, Paulo implora a Filemom que receba Onésimo, não como escravo, mas como "um irmão amado". O próprio Paulo, em um ato gracioso de amor cristão, assumiu integralmente a dívida de Onésimo: "Ponha isso em minha conta".

Filemom fornece informações históricas valiosas sobre o relacionamento da igreja primitiva com a instituição da escravidão.

O Novo Testamento em nenhum lugar ataca diretamente a escravidão; se o fizesse, as insurreições de escravos resultantes teriam sido brutalmente reprimidas e a mensagem do evangelho seria irremediavelmente confundida com a da reforma social.

O rico tema teológico que domina a carta é o perdão, um tema destacado nas Escrituras do Novo Testamento. A instrução de Paulo aqui fornece a definição bíblica de perdão, sem nunca usar a palavra.