世界の調律を影から整える謎の組織『機関』の総帥候補となった普通の高校生、都築直哉。中間テストに向けて勉強に励む直哉に訪れる新たなOJT※。そしてテスト後には修学旅行を控えていたが、そこには新たな試練が待っていた......。
※OJT（On-the-Job Training、オン・ザ・ジョブトレーニング）...企業内で行われる企業内教育・教育訓練手法のひとつ。