בספרו מאחורי הכאפייה מושיב רוני שקד את החברה הפלסטינית על ספת הפסיכולוגיה-החברתית וחושף את המניעים להתנהלותה לאורך השנים. הניתוח מוביל את המחקר אל שורשי הסכסוך בתחילת המאה הקודמת, והמסקנות העולות ממנו מובילות את המחבר לטעון כי הפרופיל הפסיכולוגי-חברתי פלסטיני נוצר כבר אז, והוא ממשיך ועובר מדור לדור ומעצים את הסכסוך ואת אופיו האלים.ניתוחו של שקד מתבסס על כלים אנליטיים מתחום הפסיכולוגיה החברתית, על ניסיונו העשיר בשירות מערכת הביטחון, בתקשורת ובאקדמיה, על תצפיות שטח ועל מגעיו השוטפים עם מנהיגים ועם פעילים מרכזיים בחברה הפלסטינית. בין השאר הוא נפגש פעמים רבות עם יאסר ערפאת, אבו מאזן, השיח' אחמד יאסין, אסמעיל הניה ובכירים נוספים.הספר עוקב אחר השינויים שחלו בעמדות הפלסטיניות, החל מדחייה מוחלטת ומלחמה טוטלית בציונות ובמדינת ישראל וכלה בפשרה המאולצת ולנכונות לקבל את חזון שתי המדינות. לטענת שקד הכישלון להגיע לפתרון על בסיס חזון זה אינו נעוץ אך ורק בצד הפלסטיני אלא נוגע גם למדיניות הישראלית, האחראית מצדה לקיפאון המדיני ואף להתעצמותו של המרכיב הדתי-לאומי בסכסוך. כל אלה מאיימים על חזון שתי המדינות ויוצרים מציאות כפויה דו-לאומית, שהיא מתכון בדוק להמשך שפיכות הדמים.מאחורי הכאפייה הוא ספר חובה לכל ישראלי המבקש להבין את שורשיו הפסיכולוגיים-חברתיים של הסכסוך, המניעים את אופיו הבלתי נשלט של מעגל הקסמים שבו אנו נתונים כבר למעלה ממאה שנה.ד"ר רוני שקד מלווה באופן פעיל את הסכסוך הישראלי-פלסטיני במשך יותר מחמישה עשורים. לאחר ששירת בשב"כ בתפקידי שטח בכירים שימש ככתב וכפרשן לעניינים פלסטינים ב"ידיעות אחרונות", ובעשור האחרון הוא חוקר את החברה והפוליטיקה הפלסטיניות במסגרת מכון טרומן באוניברסיטה העברית.ספריו הקודמים הם: "חמאס – מאמונה באללה לדרך הטרור", "השב"כ בעקבות קפוצ'י", "מירושלים לדמשק וחזרה" ו"על הגדר – רדיקליזם בקרב הערבים בישראל".