《五行原論：先秦思想的太初存有論》的「五行」不是傳統自然科學意義下的概念，也不是天人感應說下的神祕論述，而是一種原初的物的想像。本書透過「聖顯」的概念，重構中國早期的物論，指出太極、風氣、陰陽、金、木、水、火、土皆有體道的意義，道因物而顯，哲人因物以明道。 「五行」可作為「物」的總代表，其範圍由「五行」進入「兩儀」的「陰陽」以及更精微的「氣」、「渾沌」等領域。楊儒賓將「五行」視為太初時期神聖的主要展現場域，聖入物中，道在五行。這些聖顯之物構成了先秦時期詩歌隱喻的主要來源，也開啟了後世「體用不二」、「道氣為一」、「顯微無間」諸說的先聲。《五行原論：先秦思想的太初存有論》依渾沌（太極）─氣─兩儀（陰陽）─五行的次序展開，這樣的結構可視為神話版的宇宙論，也可視為另類的《太極圖說》，遙遠地印證了後世周敦頤、張載、王夫之的道論之興起。《五行原論》的「原」字既指原初的時間，也指價值意義的始源之義。