Loïk, ce petit pirate et scientifique en herbe, a visionné une bouleversante vidéo sur la pollution qui s'accumule dans la mer et menace les espèces marines. Loïk et ses amis se rendent à Mexico afin de chercher une manière de réparer certaines erreurs du passé. Mais ils doivent affronter des trafiquants sans scrupule, des contrebandiers qui ne pensent qu'à se remplir les poches. Les petits pirates braveront les intempéries et défieront les escrocs. Réussiront-ils à modifier certains comportements afin de réduire l'impact sur l'environnement ?