Dans l'année qui précède La Menace Fantôme, Yoda et le reste du Conseil Jedi sont confrontés à une galaxie au bord du changementLes Jedi ont toujours voyagé à travers les étoiles pour défendre la paix et la justice. Mais la galaxie est en train de changer, et l'Ordre Jedi avec elle. De plus en plus focalisé sur l'avenir de la République, l'Ordre est reclus sur Coruscant où les douze membres du Conseil doivent gérer toute sorte de crises galactiques. Alors qu'un autre avant-poste Jedi datant de l'âge d'or de la République est sur le point d'être fermé sur la planète Kwenn, Qui-Gon Jinn interpelle le Conseil à propos de son isolement croissant. Mace Windu suggère une idée audacieuse : les douze maîtres se rendront sur place pour venir en aide à la planète, et rappeler aux peuples de la galaxie que les Jedi restent aussi loyaux et présents qu'ils l'ont toujours été. Mais leur arrivée n'est pas du goût de tous. Plusieurs factions de pirates ont infesté le secteur, profitant de la raréfaction des Jedi pour s'imposer. Inquiets, les pillards décident alors de s'unir pour assassiner les maîtres du Conseil. Et ce, même au prix de nombreuses vies innocentes.