Accusé d'avoir volé un rubis, John va devoir enquêter aux côtés du grand détective Toadius McGee ! Orphelin, John, douze ans, a trouvé refuge dans un faux plafond du Muséum d'histoire naturelle de New York, où il dévore tous les livres qu'il peut trouver. Le soir venu, quand le musée ferme ses portes, le jeune locataire clandestin parcourt les salles d'exposition. Jusqu'au jour où la Flamme de l'Égypte, un rubis inestimable, est dérobé... Et tout accuse John ! Mais l'inspecteur Toadius McGee prend l'affaire en main, persuadé que le véritable coupable est un criminel tristement célèbre qu'il traque depuis des années. Confié au détective par la juge, John devient rapidement son Watson dans une enquête de plus en plus complexe. Car dans le dédale de la ville, entre drôles de rencontres et lieux farfelus, John, qui cherche à prouver son innocence, fait surgir des secrets de son propre passé... Et s'il était bel et bien lié à cet étrange crime ?