Alors que Old Hob perfectionne l'art de créer des mutants, les Tortues Ninja doivent décider si elles peuvent lui faire confiance dans leur lutte contre Shredder et le Clan Foot. Un autre danger se fait imminent : la mise en route du Technodrome de Krang, qui menace toute forme de vie sur la planète ! En parallèle, les Tortues se retrouvent embarquées contre leur gré dans une drôle d'aventure temporelle - dinosaures, japon féodal, pirates : tout y passe - alors que Casey & April arrivent par accident dans une autre dimension...
 

Ce tome 5 comprend les issues #38-44 de la série ongoing (Les Tortues Ninja : Le Nouvel Ordre Mutant et L'Attaque du Technodrome) ainsi que la mini-série TMNT : Turtles in Time (totalement inédite) soit 276 pages d'aventures Tortues Ninja !