本書是軒轅訣系列的第二部。緊接第一部的故事，馮慎一邊追凶查案，一面拼力與隱藏在暗處的敵對勢力斡旋。經歷同僚背叛，民眾無辜慘死後，事態逐步升級。先是天理邪教與粘杆餘黨的糾纏，再是朝中權臣與日本勢力的傾軋，最終朝廷也得知《軒轅訣》尚在世間的傳聞，派遣大內侍衛對馮慎咄咄相逼......在幾方勢力的覬覦下，馮慎身陷重圍。當走投無路之時，"死去"多年的馮父突然出現，並協同三名神秘人擊退了追兵。追兵擊退後，馮父也重傷不治。在彌留之際，馮父對馮慎說出了令人驚訝的往事，並且將馮慎託付給同來的神秘人。在肅親王和那些神秘人的幫助下，馮慎化險為夷，以假死逃出了京師。逃出後，馮慎得知了三名神秘人的身份。原來他們與自己的父親一樣，都是"萬象門"的傳人......歷史，也許就在這一刻被改寫！