「タンパク質構造予測」は、急速に進化する分子生物物理学の分野に携わるすべての人にとって欠かせないリソースです。プロの研究者、学部生や大学院生、あるいは単なる愛好家であっても、この本はタンパク質構造予測の複雑な世界に関する最先端の洞察を提供します。タンパク質構造を予測する能力は、新薬の発見から基本的な生物学的プロセスの理解まで、数多くのアプリケーションで重要な役割を果たします。この本は、タンパク質構造予測のさまざまな側面を包括的かつ詳細に探求し、理論と実際のアプリケーションの間のギャップを埋めます。

章の概要:

1: タンパク質構造予測: この章では、タンパク質構造予測の基本概念と重要性を紹介し、その後の議論の土台を築きます。

2: アルファ ヘリックス: タンパク質で最も一般的な構造モチーフの 1 つであるアルファ ヘリックスと、タンパク質の全体的な安定性と機能におけるその役割に焦点を当てます。

3: ベータ シート: ベータ シート構造、その形成、およびそれがタンパク質の三次構造と生物学的機能にどのように寄与するかを探ります。

4: タンパク質の二次構造: タンパク質のさまざまな二次構造要素を詳しく調べ、タンパク質の折り畳みと安定性への影響を説明します。

5: タンパク質の三次構造: 二次構造要素の三次元配置と、この最終構造を安定化させる力について説明します。

6: 膜トポロジー: この章では、膜タンパク質構造の予測と脂質二重層との複雑な相互作用について説明します。

7: 構造アラインメント: 相同タンパク質の比較と対比に不可欠な、タンパク質構造のアラインメントに使用される手法を紹介します。

8: 構造バイオインフォマティクス: タンパク質構造の予測と分析に使用される計算ツールと手法について説明します。

9: タンパク質構造: タンパク質構造のさまざまなレベルの概要と、それらが機能にどのように関係するかについて説明します。

10: タンパク質設計: 計算手法を使用して、特定の機能を持つタンパク質を設計するための原理と方法について説明します。

11: 格子タンパク質: タンパク質の折り畳みにおける格子モデルの概念について探究し、タンパク質構造の形成方法を理解するのに役立ちます。

12: スレッド化 (タンパク質配列): 既知の構造との配列類似性に基づいてタンパク質構造を予測するために使用されるスレッド化手法を紹介します。

13: タンパク質接触マップ: 接触マップを使用してタンパク質の折り畳みと相互作用を予測することに焦点を当てます。

14: ターン (生化学): タンパク質構造におけるターンの役割、その形成、およびタンパク質の安定性を維持する上での重要性について説明します。

15: 相同性モデリング: この章では、配列相同性に基づいてタンパク質の 3 次元モデルを作成するプロセスを探究します。

16: ループ モデリング: 機能と安定性に重要な、タンパク質のループ領域をモデリングする手法に焦点を当てます。

17: 新規タンパク質構造予測: 相同テンプレートに依存せずにタンパク質構造を予測するために使用されるアプローチを詳細に説明します。

18: タンパク質ドメイン: タンパク質のモジュール性、およびタンパク質ドメインがタンパク質の構造と機能に及ぼす重要性について説明します。

19: ファイア: タンパク質構造予測に広く使用されているツールである ファイア サーバーのケース スタディで、そのアプリケーションと方法について説明します。

20: タンパク質スーパーファミリー: タンパク質スーパーファミリーの概念と、進化生物学と機能予測におけるその重要性を紹介します。

21: イタッサー: 複数の手法を統合したタンパク質構造予測の強力な手法である イタッサー ツールの詳細な説明。

この本は、タンパク質構造予測とその実際の応用についての理解を深めたいと考えている専門家や学生にとって不可欠です。各章の概念をわかりやすく説明し、高度な手法を詳細に説明しているため、分子生物物理学の分野では必携のリソースとなっています。