Sonic findet sich in einer seltsamen Dschungelwelt wieder, in der es noch seltsamere baumbewohnende Versionen seiner Freunde gibt, die er vor einem "Monster" unter ihm beschützen muss. Sonic lernt bald, dass in den Tiefen des mysteriösen Waldlabyrinths nicht alles so ist, wie es scheint! Sonic ist schockiert, dass es sich bei dem "Monster" im Waldlabyrinth um Amy alias Thorn Rose handelt. Mit einem Paradox-Prisma-Splitter führt Thorn Krieg gegen die baumbewohnenden Aasfresser. Sonic muss diese wilden Shatter-Friends voreinander retten, um einen Weg nach Hause zu finden.