《神奇教室（北京篇）：月圆圆，过中秋》以北京为坐标，故事讲述了103班的孩子们亲手做了美味的月饼，打算乘坐泡泡飞毯，送给住在北京四合院里的兔儿爷。大家赶到时，虎将军正等着兔儿爷，两个人一早闹了点别扭，一直没见到兔儿爷回家。华优优老师带小家伙们出门寻找兔儿爷，来到颐和园，大铜牛告知大家下一个线索。一行人来到烤鸭店、看京剧的剧场，仍没有看到兔儿爷的踪迹，金大星、钱进和赵一鸣却发现了魔术师路路通、万事发的计谋。小家伙们开启营救兔儿爷的行动。月儿圆，大家终于团圆了，回到四合院，迎着月光，度过了一个开心的中秋节。北京篇的故事有些小侦探故事的色彩，围绕两条线索铺展开，华优优老师和孩子们一路寻找，顺着线索步步推进，兔儿爷巧妙地捉弄两个糊里糊涂、想把月亮变没了的魔术师。主线人物一边走进北京城的大街小巷，副线故事补充叙事情节，加快节奏进展，铺展开逗趣、紧张又悬念不断的北京历险。