遗传多样性是种质资源对环境变化适应能力的表现。种质资源的表型特征是基因型、环境以及基因型与环境相互作用的综合表现。遗传多样性和亲缘关系分析是植物种质资源研究、评价与鉴定的主要内容。对作物种质资源进行遗传多样性分析，有助于了解不同材料间的亲缘关系，为种质资源的开发利用提供重要信息，为不同生态环境间的引种或驯化提供指导。本研究分析了黄灯笼辣椒核心种质遗传多样性、甜椒核心种质遗传多样性、辣椒主要植物学性状遗传多样性及相关性、辣椒优良自交系遗传多样性、苦瓜核心种质亲缘关系、小型西瓜核心种质亲缘关系，可为瓜菜新品种选育提供理论依据。