מערכת הביטחון הוא ספר המעביר את הקורא דרך שלבי המאבק של היישוב היהודי (מאז 1886) על השגת העצמאות ובכל שלבי העימותים הצבאיים להגנתה ולהבטחת קיומה של אותה עצמאות, עד מבצע "עופרת יצוקה". את תיאור המלחמות והמאבקים מלווים תולדותיהם של כל הארגונים שהקים היישוב היהוד: ארגון השמירה של אברהם שפירא, השומר, המגן, הגדעונים, ניל"י, הגדודים העבריים, ההגנה, הפלמ"ח, האצ"ל, הלח"י והחטיבה היהודית הלוחמת. הספר מתאר את היערכות צה"ל, על יחידות העילית שלו, נגד הטרור הערבי וארגוניו ואת התמודדותו עם הסכנות החדשות: הטילים, הנשק הלא-קונבנציונלי, המרוץ לחלל והמאבק נגד הטרור. מבנה המטכ"ל וזרועות צה"ל מוגשים בספר בצורה מפורטת, כולל כלי הנשק והציוד הנלווה, וכן מתוארים מבנה משרד הביטחון וסקירה מלאה של השירותים החשאיים. כמו כן עוסק הספר במערכת המשפטית הצבאית ובקוד ההתנהגות המחייב את חיילי צה"ל. הספר מעניק לקורא תמונה נאמנה ומקיפה של המערכת הביטחונית של מדינת ישראל. מערכת הביטחון הוא הראשון בסדרה חדשה של ספרים מאת המחבר בנושאי מדינה וחברה.