Avec l'aide d'une IA de commandement, Hazel et ses amis ont réparé la brèche dans le Daedalus. Mais ce faisant, ils ont éveillé l'hostilité des « yis », les extraterrestres qui maîtrisent en réalité l'arche spatiale.
Après avoir échappé de justesse au piège tendu par ces créatures, la petite bande de Hazel doit à présent convaincre les habitants du Daedalus de l'existence des yis et de la nécessité de les combattre pour survivre. Cependant, les dirigeants humains y voient un défi à leur autorité traditionnelle.
À la recherche de preuves pour appuyer leurs dires, Hazel et ses compagnons s'aventurent de nouveau dans la section avant de l'arche, espérant y trouver une autre IA en état de fonctionnement pouvant leur renseigner sur la cachette des yis et sur leurs manigances à bord du Daedalus depuis cinq cents ans.