Un petit parisien, le jeune Basile alias Basilic, Pistou en provençal, passe de bien étranges vacances avec son pittoresque grand-père sur un bateau ancré dans le vieux port de Marseille. En même temps qu'il découvre avec son amie Valda le passé de la ville, son antique passé grec, ses galères, sa grande peste... il rencontre, lors d'une partie de pêche, un mystérieux personnage qui se cache sur une petite île... Pistou se demande comment percer le secret du comportement de l'inconnu... Y parviendra-t-il ?