小说讲述了在美国南北战争时期，五名美国北军俘虏在神秘荒岛的故事。五名北军俘虏趁人不备，乘坐气球逃离里士满，中途遭遇风暴，被抛在太平洋的一个荒岛上。他们团结互助，凭着自己的智慧和惊人的毅力，在这个他们取名为林肯岛的神秘荒岛上顽强地生存下来，并建立起富庶的家园。最后，他们登上格兰特船长的儿子罗伯特指挥的邓肯号游船，重返祖国的怀抱。